Cette rue a été ouverte en 1838 entre la rue Cuvier et la place Jussieu sous le nom de la famille Jussieu dont plusieurs membres furent des botanistes distingués. Elle coupe ainsi qu’il a été dit ci-dessus, l’emplacement de l’église de l’abbaye Saint-Victor démolie à partir de 1811.
On lui a réuni en 1869 la partie de la rue Saint-Victor comprise entre la place Jussieu et la rue du Cardinal-Lemoine.